ایزومرهای ساختاری (که به ایزومرهای کانستیتوسیونی نیز شناخته می‌شوند) ترکیباتی هستند که فرمول شیمیایی یکسانی دارند، اما نحوه اتصال اتم‌ها به یکدیگر در آنها متفاوت است. به بیان ساده‌تر، این ایزومرها بلوک‌های ساختمانی یکسانی دارند، اما با چیدمان متفاوتی کنار هم قرار گرفته‌اند.